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[생화학실험] A+, PCR 및 agarose gel 전기영동 실험2025.01.071. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 원하는 DNA band만을 증폭 가능하며, 이때 DNA polymerase가 사용된다. 30-40 cycle 정도 반복하여 증폭하고자 하는 표적 DNA의 한 DNA 사슬 3'말단에 상보적인 것과 그 반대 사슬의 3'말단에 상보적인 2개의 특정 올리고데옥시뉴클레오티드를 합성하고, 이를 원하는 절편을 함유한 변성된 한 가닥의 표적 DNA와 혼성화 반응 시킨다. DNA polymerase는 Taq DNA polymerase를 사용하며, 이는 열에 안정성이 있는 DNA...2025.01.07
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[A+] 서강대학교 일반생물학실험1 실험 11. Plasmid DNA의 제한효소 절단 및 전기영동 풀레포트2025.01.021. DNA 운반체 (Vector) DNA 운반체인 vector는 종류가 다양하며, DNA의 유지와 복제가 가능한 DNA분자이다. 그 중 plasmid는 가장 널리 쓰이는 vector이며, circular구조의 이중가닥 형태를 갖는다. plasmid는 bacteria 또는 몇몇 eukaryotic cell에 존재하는 DNA molecules로 extrachromosomal circular, double stranded의 특징을 갖는다. Chromosomal DNA와는 독립적으로 자가복제가 가능하며 일반적인 bacteria genom...2025.01.02
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_2차 풀레포트_TA Cloning과 Mini-Prep, Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. TA Cloning TA Cloning은 PCR을 거친 product의 3'에 존재하는 A overhang과 T vector의 3'의 T overhang의 상보성으로 인해 cloning을 진행하는 기법이다. Lac Z selection을 통해 blue colony와 white colony를 확인하여 insert DNA가 정상적으로 삽입되었는지 확인할 수 있다. Self-ligation을 줄이기 위해 alkaline phosphatase 처리나 T-overhang cloning protocol 수정 등의 방법을 사용할 수 있다....2025.01.18
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Site-directed mutagenesis & DNA sequencing2025.01.181. Site-directed mutagenesis Site-directed mutagenesis는 원하는 돌연변이를 포함하는 짧은 DNA primers를 사용하여 DNA 염기서열 특정 위치의 mutation을 일으켜 돌연변이를 얻는 방법입니다. 이 방법을 이용하여 GFP의 chromophore 아미노산 서열을 변경하여 다양한 색상의 형광 단백질을 만들 수 있습니다. 2. DNA sequencing DNA sequencing은 DNA를 구성하는 염기 순서를 결정하는 작업입니다. Sanger sequencing 방법은 dNTP와 dd...2025.01.18
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Plasmid purification & DNA 정량 A+ report2025.01.171. Plasmid DNA transformation Plasmid DNA transformation이란 특정 종의 세포에 외부 유전자를 도입하여 그 세포가 새로운 유전자 정보를 표현하도록 하는 과정이다. 간단히 말해, ligation된 plasmid를 숙주세포 안으로 넣어주는 것이다. 일반적으로, plasmid는 작은 원형 DNA 조각으로서 bacteria와 같은 원핵생물의 세포외부에서도 독립적으로 복제할 수 있는 DNA이다. 특정 유전자 조각을 plasmid에 삽입한 후, host cell에 도입해서 해당 유전자가 host ce...2025.01.17
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immunoblots2025.01.221. Immunoblotting Immunoblotting(western blotting)은 전기영동 후 단백질, 특히 양이 적은 단백질의 면역검출을 위한 강력하고 중요한 절차이다. Immunoblotting을 통해 nitrocellulose 또는 polyvinylidene fluoride(PVDF)와 같은 단백질 유지 막 지지체에 고정된 단백질 항원을 검출할 수 있다. 관심 단백질의 검출은 membrane에 노출된 관심 단백질을 특이적으로 인식하는 항체의 결합에 의존한다. 2. House keeping gene House keep...2025.01.22
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생화학 실험 보고서 - PCR2025.01.271. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR은 중합효소 연쇄반응으로, 열을 가하여 DNA의 특정 부분을 증폭시키는 기술이다. reverse transcription PCR은 mRNA에 대해 PCR을 적용하기 위한 방법으로, mRNA를 역전사시켜 cDNA를 합성하고 primer와 DNA polymerase를 이용해 DNA의 일부분을 복제, 증폭시킨다. PCR은 Denaturation, Annealing, Extension의 3단계로 진행되며, 주형 DNA, primer, dNTP, DNA polymerase가 ...2025.01.27
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식물분자생물학실험 Plant genomic DNA extraction 결과보고서2025.01.181. DNA purification DNA extraction이라고도 불리는 DNA purification은 DNA를 각종 시료에서 얻어낸 sample로부터 추출하고, 물리적, 화학적 방법을 이용하여 DNA만 정제하는 방법을 말한다. 이를 위해 cell을 녹이고, 불필요한 다른 물질을 제거하는 과정이 필요하다. 대표적인 DNA purification 방법으로 organic extraction (phenolchloroform method), nonorganic method (salting out and proteinase K trea...2025.01.18