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A+ 생화학실험 <6주차. Plasmid DNA Miniprep> 레포트2025.01.201. Plasmid DNA Plasmid DNA는 박테리아 내에 존재하는 extrachromosomal DNA로, 자체적 복제가 가능한 복제 기점을 가지고 있습니다. 생존에 필수적이지 않은 정보를 담고 있으며, 항생제 내성 유전자 같은 선택적 마커가 포함되기도 합니다. 이를 통해 항생제가 포함된 배지에서 cell-selection을 진행할 수 있으며, 이로부터 유전자 발현 여부를 조사할 수 있습니다. 또한 plasmid DNA는 super coiled 형태의 DNA로, 유전자 조작, 분리, cloning 등 유전공학 분야에 용이하게...2025.01.20
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미생물학 transformation 형질전환 실험 레포트2025.01.031. Transformation 실험을 통해 plasmid DNA를 competent cell에 도입하여 colony를 관찰함으로써 transformation 과정을 이해할 수 있었다. competent cell은 온도와 충격에 민감하므로 실험 시 주의해서 다뤄야 하며, 배지에 spreading 시 배지가 파이지 않도록 조심해서 다뤄야 한다. 또한 암피실린에 저항성을 가지는 유전자가 competent cell에는 없어서 암피실린이 포함된 배지에서 살아남을 수 없지만, 제대로 transformation이 일어난 세포는 암피실린이 포함...2025.01.03
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대장균 배양, 형질전환, Plasmid DNA 분리, DNA 전기영동 실험 보고서2025.01.121. 대장균(E.coli) 대장균(E.coli)은 그람음성 간균으로, 포자를 생성하지 않으며 1-2 microns x 30-30 micron 크기의 박테리아입니다. 섭씨 37도에서 잘 자라며, 정상적인 인간의 장에 존재하여 건강에 유익합니다. 하지만 배설물과 함께 나와 질병을 일으킬 수 있습니다. 2. 배지 배지는 미생물이나 세포를 성장시키는데 사용됩니다. 가장 일반적인 배지는 액체 영양배지나 LB배지이며, 이를 Agar와 섞어 고체배지로 사용할 수 있습니다. 이번 실험에서 사용한 LB배지는 tryptone, yeast extrac...2025.01.12
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[서강대학교 현대생물학실험2] (2차 풀레포트) TA cloning & transformation, mini-prep, Enzyme cut, electrophoresis2025.01.221. TA cloning TA cloning을 통해 insert를 삽입한 vector는 transformation을 이용해 세포에 주입하여 lacZ selection으로 insert 삽입 여부를 확인할 수 있다. lacZ operon이 작동하면 β-1, 4-linkage를 분해 시킬 수 있는 β-galactosidase가 생성된다. X-gal(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactopyranoside)은 β-1, 4 linkage를 가지고 있으며 이 linkage가 분해되면 파란색을 띠게 된다. 2. Tra...2025.01.22
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_2차 풀레포트_TA Cloning과 Mini-Prep, Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. TA Cloning TA Cloning은 PCR을 거친 product의 3'에 존재하는 A overhang과 T vector의 3'의 T overhang의 상보성으로 인해 cloning을 진행하는 기법이다. Lac Z selection을 통해 blue colony와 white colony를 확인하여 insert DNA가 정상적으로 삽입되었는지 확인할 수 있다. Self-ligation을 줄이기 위해 alkaline phosphatase 처리나 T-overhang cloning protocol 수정 등의 방법을 사용할 수 있다....2025.01.18
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Plasmid purification & DNA 정량 A+ report2025.01.171. Plasmid DNA transformation Plasmid DNA transformation이란 특정 종의 세포에 외부 유전자를 도입하여 그 세포가 새로운 유전자 정보를 표현하도록 하는 과정이다. 간단히 말해, ligation된 plasmid를 숙주세포 안으로 넣어주는 것이다. 일반적으로, plasmid는 작은 원형 DNA 조각으로서 bacteria와 같은 원핵생물의 세포외부에서도 독립적으로 복제할 수 있는 DNA이다. 특정 유전자 조각을 plasmid에 삽입한 후, host cell에 도입해서 해당 유전자가 host ce...2025.01.17
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Plasmid DNA 정제2025.01.131. 대장균(E. coli) 대장균(E.coli)은 Theodor Esherich의 이름을 따서 발견되어 명명된 박테리아이다. 특징으로는 그람음성의 간균이며, 포자 생성을 하지 않으며, 1-2 microns x 30-30 micron (1 micron = 0.001 mm)크기이고, 섭씨 37도에서 쉽게 자랄 수 있다. 2. Plasmid DNA Plasmid DNA란 세균 속에 주 DNA와 별도로 존재하면서 증식할 수 있는 고리 형태의 DNA로, 원핵생물과 효모 등에서 발견된다. 대장균 세포에서 분리된 Plasmid DNA는 sup...2025.01.13
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DNA Ligation & Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. DNA Ligation & Transformation 제한효소를 처리하여 얻어낸 insert DNA를 T4 DNA ligase를 이용하여 vector에 삽입한다. DNA strand의 5'에 존재하는 인산기와 3'에 존재하는 OH기 사이에 phosphodiester bond를 형성하여 ligation하고, ligation product를 competent cell에 형질전환한 다음 plate에 ampicillin resistance에 의해 생성된 colony를 selection한다. 2. Mini-scale preparatio...2025.01.18
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Restriction Enzyme Digestion and Gel Electrophoresis 레포트2025.01.211. Plasmid DNA와 Vector Plasmid DNA는 박테리아 세포 내에 염색체와 별도로 존재하면서 독자적으로 복제, 증식할 수 있는 원형 DNA 분자를 말한다. Plasmid Vector는 원하는 특정 유전자를 운반할 수 있고, 한 세대의 박테리아로부터 다음 세대로 전달되기 때문에, DNA 클로닝을 위한 핵심적인 도구이다. Vector에는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site과, 클로닝이 이루어진 후 많은 박테리아 중에서 vector를 가지고 있는 박테리아만 분리할 수 있도록 하는...2025.01.21
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제한효소와 아가로즈젤 전기영동/ Restriction Digest and Agarose Gel Electrophoresis2025.01.121. Plasmid DNA Plasmid DNA는 재조합 DNA 조작을 위한 운반체 DNA로 사용되며, 대장균에 vector를 삽입하는 과정을 Bacterial Transformation이라고 한다. 대장균 cell에는 plasmid DNA와 대장균 cell의 염색체 DNA인 chromosomal DNA가 독자적으로 존재하기 때문에 plasmid DNA를 따로 분리하는 과정을 Purification of plasmid DNA라고 한다. 일반적으로 Restriction enzymes를 처리하지 않은 plasmid DNA의 경우 ope...2025.01.12
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