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인천대학교 나노바이오실험(1) A 자료) 5. Restriction Enzyme Cutting2025.01.041. Restriction Enzyme Cutting 이번 실험은 지난 실험에서 E.coli 배양액에서 Alkaimen Lysis mothod으로 추출한 plasmid DNA를 restriction enzyme을 사용하여 절단하였다. 그리고 gel electrophoresis를 통해, 절단된 plasma DNA를 확인하는 것을 목표로 하였다. 실험 결과, 5,000~6,000 bp의 band와 700~1,000 bp의 bnad로 2개의 주요한 DNA band를 관찰할 수 있었다. 추가로, gel 아랫부분에 몇 개의 DNA band가...2025.01.04
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[A+] 서강대학교 일반생물학실험1 실험 11. Plasmid DNA의 제한효소 절단 및 전기영동 풀레포트2025.01.021. DNA 운반체 (Vector) DNA 운반체인 vector는 종류가 다양하며, DNA의 유지와 복제가 가능한 DNA분자이다. 그 중 plasmid는 가장 널리 쓰이는 vector이며, circular구조의 이중가닥 형태를 갖는다. plasmid는 bacteria 또는 몇몇 eukaryotic cell에 존재하는 DNA molecules로 extrachromosomal circular, double stranded의 특징을 갖는다. Chromosomal DNA와는 독립적으로 자가복제가 가능하며 일반적인 bacteria genom...2025.01.02
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_2차 풀레포트_TA Cloning과 Mini-Prep, Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. TA Cloning TA Cloning은 PCR을 거친 product의 3'에 존재하는 A overhang과 T vector의 3'의 T overhang의 상보성으로 인해 cloning을 진행하는 기법이다. Lac Z selection을 통해 blue colony와 white colony를 확인하여 insert DNA가 정상적으로 삽입되었는지 확인할 수 있다. Self-ligation을 줄이기 위해 alkaline phosphatase 처리나 T-overhang cloning protocol 수정 등의 방법을 사용할 수 있다....2025.01.18
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DNA Ligation & Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. DNA Ligation & Transformation 제한효소를 처리하여 얻어낸 insert DNA를 T4 DNA ligase를 이용하여 vector에 삽입한다. DNA strand의 5'에 존재하는 인산기와 3'에 존재하는 OH기 사이에 phosphodiester bond를 형성하여 ligation하고, ligation product를 competent cell에 형질전환한 다음 plate에 ampicillin resistance에 의해 생성된 colony를 selection한다. 2. Mini-scale preparatio...2025.01.18
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DNA cloning 방법/enzyme, transformation, selection mark/생화학 보고서2025.01.201. DNA cloning 방법 DNA cloning은 타깃 유전자를 박테리아의 게놈에서 잘라내어 plasmid에 삽입하는 과정입니다. 이 과정에서 restriction enzyme을 사용하여 유전자를 자르고, ligase를 사용하여 유전자를 plasmid에 붙입니다. 이렇게 만들어진 recombinant vector는 박테리아에 형질전환되어 증폭됩니다. 형질전환 과정에서는 열처리를 통해 세포막을 열어 plasmid가 들어가게 하며, 항생제 내성 유전자를 선별 마커로 사용하여 형질전환된 세포를 선별합니다. 2. Enzyme 사용 D...2025.01.20
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람다 파지 DNA 관찰, PFU test 및 Optical mapping_서강대학교 바이오융합기술프로젝트1 레포트2025.01.191. λ phage DNA 관찰 실험에서는 DNA damaging을 이해하기 위한 첫 단계로 λ phage를 이용하여 DNA observation을 진행하였다. DNA가 포함된 plug에 proteinase K를 처리하여 phage의 구조 단백질과 DNase를 제거하고, (+)전하 cover glass 위에 DNA를 고정시켜 관찰하였다. PDMS nanochannel을 사용하여 DNA가 일직선으로 펴지도록 하여 관찰하였다. 2. PFU test PFU test를 통해 미지의 농도의 λ phage 용액 내 phage 입자의 개수를 확...2025.01.19
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Restriction Enzyme Digestion and Gel Electrophoresis 레포트2025.01.211. Plasmid DNA와 Vector Plasmid DNA는 박테리아 세포 내에 염색체와 별도로 존재하면서 독자적으로 복제, 증식할 수 있는 원형 DNA 분자를 말한다. Plasmid Vector는 원하는 특정 유전자를 운반할 수 있고, 한 세대의 박테리아로부터 다음 세대로 전달되기 때문에, DNA 클로닝을 위한 핵심적인 도구이다. Vector에는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site과, 클로닝이 이루어진 후 많은 박테리아 중에서 vector를 가지고 있는 박테리아만 분리할 수 있도록 하는...2025.01.21
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DNA ligation, Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA2025.01.221. DNA ligation DNA ligation은 T4 DNA ligase 효소를 이용하여 DNA 말단을 phosphodiester 결합으로 연결하는 과정이다. 이 과정에서 vector와 insert의 ligation, vector의 self-ligation, insert의 self-ligation 등 세 가지 형태가 나타날 수 있다. 본 실험에서는 HindⅢ와 NdeⅠ로 double-digestion한 vector와 insert를 T4 DNA ligase로 ligation하였다. 2. Transformation ligation...2025.01.22