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Purification of Plasmid DNA by Mini-prep2025.01.211. Plasmid DNA Plasmid DNA는 bacterial cell의 소기관으로서 transformation 등 다양한 곳에 사용된다. Plasmid DNA는 host cell 당 적게는 1~3개, 많게는 수십 개까지 복제되기도 한다. Plasmid DNA 또한 유전자를 지녔기에 transformation을 일으킬 수 있으며, vector로서 사용되기도 한다. 2. Plasmid DNA Purification Mini-prep은 bacteria로부터 plasmid DNA만을 정제하는 실험법이다. 수확한 bacteria에 다...2025.01.21
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Plasmid DNA 정제2025.01.131. 대장균(E. coli) 대장균(E.coli)은 Theodor Esherich의 이름을 따서 발견되어 명명된 박테리아이다. 특징으로는 그람음성의 간균이며, 포자 생성을 하지 않으며, 1-2 microns x 30-30 micron (1 micron = 0.001 mm)크기이고, 섭씨 37도에서 쉽게 자랄 수 있다. 2. Plasmid DNA Plasmid DNA란 세균 속에 주 DNA와 별도로 존재하면서 증식할 수 있는 고리 형태의 DNA로, 원핵생물과 효모 등에서 발견된다. 대장균 세포에서 분리된 Plasmid DNA는 sup...2025.01.13
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인천대학교 나노바이오실험(1) A 자료) 5. Restriction Enzyme Cutting2025.01.041. Restriction Enzyme Cutting 이번 실험은 지난 실험에서 E.coli 배양액에서 Alkaimen Lysis mothod으로 추출한 plasmid DNA를 restriction enzyme을 사용하여 절단하였다. 그리고 gel electrophoresis를 통해, 절단된 plasma DNA를 확인하는 것을 목표로 하였다. 실험 결과, 5,000~6,000 bp의 band와 700~1,000 bp의 bnad로 2개의 주요한 DNA band를 관찰할 수 있었다. 추가로, gel 아랫부분에 몇 개의 DNA band가...2025.01.04
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Plasmid DNA miniprep2025.05.141. Plasmid DNA Plasmid DNA는 bacteria에 존재하는 extrachromosomal DNA로, 자체적으로 복제 가능한 복제기점을 갖고 있다. Plasmid DNA는 genomic DNA와 달리 생존에 필수적이지 않은 정보를 포함하고 있으며, 이를 이용하여 유전자 발현 여부를 조사할 수 있다. Plasmid DNA는 supercoiled DNA 형태를 가지고 있어 유전자 분리, 조작, cloning 등 유전공학에 활용되기 쉽다. 2. Plasmid DNA extraction Plasmid DNA를 활용하기 위해...2025.05.14
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제한효소와 아가로즈젤 전기영동/ Restriction Digest and Agarose Gel Electrophoresis2025.01.121. Plasmid DNA Plasmid DNA는 재조합 DNA 조작을 위한 운반체 DNA로 사용되며, 대장균에 vector를 삽입하는 과정을 Bacterial Transformation이라고 한다. 대장균 cell에는 plasmid DNA와 대장균 cell의 염색체 DNA인 chromosomal DNA가 독자적으로 존재하기 때문에 plasmid DNA를 따로 분리하는 과정을 Purification of plasmid DNA라고 한다. 일반적으로 Restriction enzymes를 처리하지 않은 plasmid DNA의 경우 ope...2025.01.12
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[일반생물학실험] Plasmid DNA - 전기영동2025.01.031. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 DNA를 크기에 따라 분리하는 기술입니다. DNA는 인산기를 가지고 있어 전기영동 완충용액에서 음전하를 띠게 되며, 전류를 흘려주면 양극 쪽으로 이동하게 됩니다. DNA 분자량이 클수록, agarose 농도가 높을수록, 전압이 낮을수록 이동속도가 느려집니다. 또한 DNA 구조에 따라서도 이동속도가 달라집니다. 전기영동 후 ethidium bromide로 염색하면 UV 조사 시 형광을 발하여 DNA를 확인할 수 있습니다. 1. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 생명과학 분야에서 매우 중요한 기술...2025.01.03
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_2차 풀레포트_TA Cloning과 Mini-Prep, Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. TA Cloning TA Cloning은 PCR을 거친 product의 3'에 존재하는 A overhang과 T vector의 3'의 T overhang의 상보성으로 인해 cloning을 진행하는 기법이다. Lac Z selection을 통해 blue colony와 white colony를 확인하여 insert DNA가 정상적으로 삽입되었는지 확인할 수 있다. Self-ligation을 줄이기 위해 alkaline phosphatase 처리나 T-overhang cloning protocol 수정 등의 방법을 사용할 수 있다....2025.01.18
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DNA Ligation & Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA Restriction enzyme & Gel electrophoresis2025.01.181. DNA Ligation & Transformation 제한효소를 처리하여 얻어낸 insert DNA를 T4 DNA ligase를 이용하여 vector에 삽입한다. DNA strand의 5'에 존재하는 인산기와 3'에 존재하는 OH기 사이에 phosphodiester bond를 형성하여 ligation하고, ligation product를 competent cell에 형질전환한 다음 plate에 ampicillin resistance에 의해 생성된 colony를 selection한다. 2. Mini-scale preparatio...2025.01.18
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[서강대학교 현대생물학실험2] (2차 풀레포트) TA cloning & transformation, mini-prep, Enzyme cut, electrophoresis2025.01.221. TA cloning TA cloning을 통해 insert를 삽입한 vector는 transformation을 이용해 세포에 주입하여 lacZ selection으로 insert 삽입 여부를 확인할 수 있다. lacZ operon이 작동하면 β-1, 4-linkage를 분해 시킬 수 있는 β-galactosidase가 생성된다. X-gal(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactopyranoside)은 β-1, 4 linkage를 가지고 있으며 이 linkage가 분해되면 파란색을 띠게 된다. 2. Tra...2025.01.22
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DNA ligation, Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA2025.01.221. DNA ligation DNA ligation은 T4 DNA ligase 효소를 이용하여 DNA 말단을 phosphodiester 결합으로 연결하는 과정이다. 이 과정에서 vector와 insert의 ligation, vector의 self-ligation, insert의 self-ligation 등 세 가지 형태가 나타날 수 있다. 본 실험에서는 HindⅢ와 NdeⅠ로 double-digestion한 vector와 insert를 T4 DNA ligase로 ligation하였다. 2. Transformation ligation...2025.01.22
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