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Protein Regulation2025.01.181. Auxin-induced degron system Auxin-induced degron system은 특정 target protein을 원하는 상황에서 제거하기 위해 사용되는 방식으로, AID가 결합된 protein과 OsTir1이 같이 존재할 경우에 IAA(auxin)가 존재하지 않을 경우에는 정상적으로 protein이 존재할 수 있지만, IAA가 존재할 경우 IAA가 AID와 OsTir1을 연결하는 bridge 역할을 하고 polyubiquitin 구조가 형성되며 이는 이후 proteosome에 의해 빠르게 분해되어 pro...2025.01.18
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생명과학실험1 Western Blot2025.01.171. Western Blot Western Blot은 gel 전기영동을 통해 단백질을 분리하고, 특정 단백질의 존재 여부를 확인하는 실험이다. 이 실험에서는 SDS-PAGE를 이용하여 단백질을 크기별로 분류하고, 분류된 단백질을 membrane으로 옮긴 후에 항원-항체 상보적 결합을 이용하여 단백질의 존재 여부를 시각화하여 결과를 확인한다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS라는 detergent를 사용하여 단백질의 구조를 선형으로 만듦으로써 단백질의 전하 밀도를 일정하게 만들고, 결국 단백질들이 크기로만 분류될 수 있게...2025.01.17
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유전학실험 Gene insertion & deletion2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA를 빠르게 증폭시키는 방법으로, Denaturation, Annealing, Elongation의 3단계로 구성된다. Denaturation에서 DNA는 95℃의 고온에 의해 single strand가 되며, Annealing에서 primer가 결합한다. Elongation에서는 약 75℃에서 DNA polymerase의 작용에 의해 DNA의 길이 신장이 일어난다. PCR의 결과값에 영향을 미치는 요인에는 각 단계의 온도, cycle 횟수, buffer s...2025.01.18
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Western blot 실험 방법2025.05.101. Western blotting Western blotting (immunoblotting)은 샘플 내 특정 단백질의 존재 여부, 양, 크기를 측정하는 실험이다. 단백질이 소량이어도 검출 가능하고, 다양한 종류의 단백질이 혼합된 시료를 검사할 때도 항체의 기질 특이성 덕분에 원하는 단백질만 검출할 수 있다는 장점이 있다. 2. Western blot 실험 순서 Western blot 실험은 크게 5개의 순서로 이루어진다. 1) SDS-PAGE를 시행하여 단백질을 크기별로 분리, 2) 분리된 단백질을 membrane에 전이, 3)...2025.05.10
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Cell Transfection and Cell lysis 레포트2025.01.211. Cell Transfection Cell transfection은 관심있는 외부 gene을 세포에 인공적으로 도입하여 외부 DNA가 세포 내에서 발현되도록 하는 과정입니다. 이를 통해 세포의 특성을 변화시켜 유전자나 단백질의 발현과 기능을 연구할 수 있습니다. 다양한 화학적, 물리적, 바이러스 매개 방법이 사용되며, 특히 HEK-293T 세포는 transfection 효율이 높아 널리 사용됩니다. 또한 epitope tagging 기술을 통해 단백질의 특성을 분석할 수 있습니다. 2. Cell Lysis Cell lysis는 ...2025.01.21
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Protein electro-transfer and Western blot 실험보고서2025.01.161. Western blot Western blot은 찾고자 하는 protein의 antigen epitope와 반응하는 antibody를 이용하여 단백질 혼합물 중에서 원하는 단백질(antigen)을 찾아내는 방법이다. 전기 영동을 이용하여 단백질을 gel 상에서 크기에 따라 분리한 후, membrane에 transfer한다. Membrane에 발광하는 probe가 붙어 있는 antibody를 붙여주는 항원-항체 반응을 이용하여 찾고자 하는 특정 단백질을 검출한다. 2. Nitrocellulose membrane Nitrocell...2025.01.16
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Cell harvest and protein assay2025.01.231. Cell harvest 세포 배양 시 adherent cell과 suspension cell로 구분할 수 있으며, adherent cell을 harvest하는 방법에는 화학적 방법(trypsin, accutase 사용)과 물리적 방법(scraper 사용)이 있다. 이번 실험에서는 물리적 방법인 scraper를 사용하여 adherent cell을 harvest하였다. 2. Protein extraction 세포 내 단백질을 추출하기 위해 lysis buffer와 phosphatase/protease inhibitor를 사용하여 ...2025.01.23
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Western Blot)2025.01.231. Western Blot 원리 Western Blot은 항원-항체 반응을 이용하여 여러 단백질의 혼합물로부터 특정 단백질을 찾아내는 방법이다. 이 실험에서는 단백질의 SDS-PAGE 분리, 단백질의 membrane으로의 transfer, 항원-항체 반응 및 항체에 부착된 효소의 반응에 의한 발색 반응 등의 실험 원리 및 기법을 습득한다. 2. SDS-PAGE와 Stacking/Resolving Gel의 차이 Stacking gel은 단백질 시료를 gel에 loading 했을 때 모든 시료가 동일한 시작점에서 출발할 수 있도록 하...2025.01.23
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Protein Electro-transfer and Western blot2025.01.231. Western blotting Western blotting은 단백질에 대한 blotting 기술을 뜻하며, 항원-항체 반응을 이용한다. 단백질 혼합물을 polyacrylamide gel에서 SDS-PAGE를 이용하여 크기에 따라 분리하고 membrane으로 electro-transfer하여 흡착시킨 후 membrane 표면에서 항체를 이용하여 원하는 단백질의 존재를 확인하는 전반적인 과정을 의미한다. 2. SDS의 역할 및 원리 SDS-PAGE는 SDS가 단백질에 일정 간격으로 결합하여 charge density를 일정하게 ...2025.01.23
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[생화학실험] Western blot Analysis 완충용액 제조와 시약 제조 시 유의사항2025.01.291. Western Blot Analysis Western Blot은 전기영동을 통해 분리된 단백질 중 항원-항체 반응을 이용하여 특정 단백질의 존재를 확인하는 방법입니다. 실험 과정 중 과도한 pH 변화를 안정화시키기 위해 완충용액(Buffer)를 사용하는데, Western Blot Analysis에 필요한 완충용액은 Tris-Buffered Saline, Tris-Glycine, Transfer Buffer 등이 있습니다. 2. Tris-Buffered Saline Tris-Buffered Saline은 용액의 pH를 조절하는 ...2025.01.29
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