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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(SDS-PAGE, Coomassie Blue Staining)2025.01.231. SDS의 역할 및 원리 SDS는 계면활성제의 일종으로 단백질이나 핵산의 구조를 깨뜨려 선형으로 만들어주는 역할을 한다. 아미노산 두 개에 SDS 한 개가 결합하고 SDS분자의 긴 소수성 꼬리가 단백질의 골격을 감싸면서 음전하를 띈 꼬리의 끝부분이 밖으로 향하게 되므로 단백질은 자신이 본래 가지고 있던 전하와 관계없이 -전하를 띄게 된다. 2. PAGE의 원리 PAGE란 acrylamide의 중합반응으로 만들어진 gel을 이용한 전기 영동법을 말한다. acrylamide를 가교제로 중합한 polyacrylamide gel은 가교...2025.01.23
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SDS-PAGE를 이용한 AP 단백질 분석 및 Coomassie Blue Staining2025.01.171. SDS-PAGE를 이용한 단백질 분석 SDS-PAGE 실험을 통해 AP 단백질의 크기와 순도를 확인할 수 있었습니다. SDS-PAGE 과정에서 단백질의 3차 구조를 제거하고 크기에 따라 분리되도록 하여, 목표 단백질인 AP 단백질을 선별적으로 확인할 수 있었습니다. 또한 Coomassie Blue 염색을 통해 단백질 밴드를 시각화하여 분석할 수 있었습니다. 2. 단백질 정제 과정 단백질 정제 과정에서 target 단백질 이외의 비특이적으로 결합한 단백질들이 씻겨나가면서 target 단백질의 순도가 높아지는 것을 확인할 수 있었...2025.01.17
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생명과학실험1 Western Blot2025.01.171. Western Blot Western Blot은 gel 전기영동을 통해 단백질을 분리하고, 특정 단백질의 존재 여부를 확인하는 실험이다. 이 실험에서는 SDS-PAGE를 이용하여 단백질을 크기별로 분류하고, 분류된 단백질을 membrane으로 옮긴 후에 항원-항체 상보적 결합을 이용하여 단백질의 존재 여부를 시각화하여 결과를 확인한다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS라는 detergent를 사용하여 단백질의 구조를 선형으로 만듦으로써 단백질의 전하 밀도를 일정하게 만들고, 결국 단백질들이 크기로만 분류될 수 있게...2025.01.17
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[만점자료] DNA전기영동과 SDS-PAGE 실험 보고서2025.01.231. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 PCR을 통해 유전자를 증폭시킨 후, 전기를 이용해 DNA를 크기별로 분리하는 기술이다. PCR은 DNA 변성, Primer 부착, 신장 과정을 거치며 유전자를 지수적으로 증폭시킬 수 있다. 아가로오스 겔 전기영동은 한천을 이용해 만든 겔을 통해 DNA를 크기별로 분류할 수 있다. 실험 결과에서는 원래 플라스미드, 제한효소 처리 플라스미드, PCR 증폭 산물 등의 밴드를 확인할 수 있었다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS를 이용해 단백질에 균일한 음전하를 부여하고, 폴리아크릴아마...2025.01.23
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SDS-PAGE를 이용한 단백질의 분석2025.01.231. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS가 단백질에 일정 간격으로 결합하여 charge density를 일정하게 하고, 단백질을 변형시켜 모든 단백질이 일정 모양(선형)을 갖게 함으로써 단백질이 전기장에서 크기(분자량)에만 의존적으로 분리되게 한다. Stacking gel과 Resolving gel의 pH 차이로 인해 단백질이 크기별로 분리된다. Coomassie blue 염색을 통해 단백질 band를 확인할 수 있다. 2. 단백질 정제 실험 결과, sample2에서 Naa30 protein의 사이즈에 해당하는 protein ...2025.01.23
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대장균에서 재조합 단백질의 생산과 Western blot에 관한 실험2025.01.131. IPTG IPTG는 대장균 lactose operon의 효소합성을 유도하는 강력한 유도물질이다. 보통 유도물질은 operon의 활동에 의해 만들어지는 β-D-galactosidase에 의해 대사 이용하는 것이 많지만, IPTG는 분해되지 않아 비대사성 유도물질이라고도 불린다. 또한, 고농도로 사용시 galactoside permease가 없는 세포에도 투과할 수 있기 때문에 permease가 없는 균주에서의 유도실험에도 사용된다. 2. Buffer condition Tank buffer에는 glycine과 Cl-(Tris-ba...2025.01.13
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[충남대] 분자생물, 생화학 실험 보고서12025.01.281. 대장균 배양 실험에서는 대장균(Escherichia coli, E. coli.)을 이용하여 실험을 진행하였다. 대장균은 정온동물의 창자에서 많이 볼 수 있는 박테리아로 단백질 발현에 대해 가장 일반적인 숙주이다. 대장균은 실험실에서 보관과 배양이 용이하다는 장점이 있어 주로 사용하는 원핵생물 모델이며, 자가복제를 하는 DNA 고리인 Plasmid DNA를 가지고 있다. 이는 DNA vector(운반체)로써 유전자 재조합 기술의 중요한 재료이다. 2. 배지 제조 실험에서는 TB(Terrific broth) 배지를 사용하였다. T...2025.01.28
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PAGE를 이용한 단백질의 검정2025.05.131. 단백질의 구조와 기능 단백질은 아미노산이라는 작은 구성인자의 중합체이며, 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있다. 단백질은 효소, 호르몬, 항체, 수송 단백질, 수용체 단백질, 운동 단백질, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행한다. 단백질은 pH, 염의 농도, 온도 등의 변화에 의해 변성될 수 있다. 2. 전기영동을 이용한 단백질 분리 전기영동은 전기적 힘을 이용하여 단백질과 같은 큰 분자들을 gel에서 이동시켜 크기에 따라 분리하는 기술이다. SDS-PAGE는 SDS와 polyacrylamide를 이...2025.05.13
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단백질의 분리2025.01.231. 단백질 분리 실험을 통해 원심분리를 이용하여 세포 내 단백질을 분리하는 방법을 익혔다. 단백질 분리를 위해 세포를 깨고 RIPA 버퍼에 녹인 후 원심분리하여 상층액을 얻었다. 이 상층액에는 세포에서 추출된 단백질이 포함되어 있다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질의 크기에 따라 분리하는 기법으로, 단백질이 SDS에 의해 변성되어 전하/분자량 비율이 동일해지면 전기장 내에서 크기에 따라 이동속도가 달라져 분리된다. 이를 통해 단백질의 분자량을 확인할 수 있다. 3. 세포 용해 세포를 깨는 방법에는 homogeniza...2025.01.23
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Cell harvest and protein assay2025.01.231. Cell harvest 세포 배양 시 adherent cell과 suspension cell로 구분할 수 있으며, adherent cell을 harvest하는 방법에는 화학적 방법(trypsin, accutase 사용)과 물리적 방법(scraper 사용)이 있다. 이번 실험에서는 물리적 방법인 scraper를 사용하여 adherent cell을 harvest하였다. 2. Protein extraction 세포 내 단백질을 추출하기 위해 lysis buffer와 phosphatase/protease inhibitor를 사용하여 ...2025.01.23
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