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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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생물공정실험 결과보고서 - Gene Expression Analysis by RT-PCR2025.01.041. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) 이 실험의 목적은 reverse transcription PCR을 통해 얻은 cDNA 샘플을 real-time PCR로 증폭시키는 것입니다. 다양한 시약을 사용하여 cancer cell과 ADSC cell의 유전자 발현, 특히 housekeeping gene인 GAPDH와 target gene인 Thy-1의 발현 차이를 분석하고자 합니다. 2. Real-time PCR 분석 실험 결과를 통해 ΔCt 값을 계산하여 각 세포주에서 target gene인 Thy-1이 h...2025.01.04
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[생물공정실험] 3주차 Gene expression analysis by RT-PCR 예비보고서2025.04.261. cDNA 정의 및 합성 방법 cDNA(complementary DNA)는 RNA를 주형으로 역전사효소와 DNA 중합효소에 의해 합성된 DNA입니다. 역전사효소를 이용한 cDNA 합성에서는 RNA와 annealing 위치에 따라 3종류의 primer를 사용할 수 있습니다. (1) 역전사 효소 (reverse transcriptase; RTase), (2) RT반응에 사용하는 primer (oligo dT primer, random primer, gene-specific primer). 2. Downstream applicatio...2025.04.26
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[생화학실험] RT-PCR을 통한 간암 세포주에 대한 약물 효능 평가2025.01.291. RT-PCR RT-PCR은 역전사 반응과 PCR 반응을 이용하여 원하는 주형 mRNA의 상보적 염기쌍인 cDNA를 합성, 증폭시키는 분자생물학적 기술이다. 본 실험에서는 RT-PCR을 통해 간암 세포주 HepG2 cell에 처리한 Salsolinol이 Cyclin D1 경로에서 암세포 사멸에 유의미한 결과를 보이는지 관찰하였다. 2. Cyclin D1 Cyclin D1은 세포 주기 조절에 관여하는 단백질로, 암세포의 증식을 억제하는 역할을 한다. 본 실험에서는 Salsolinol 처리가 Cyclin D1 경로를 통해 HepG2...2025.01.29
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겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis) 실험 리포트2025.01.141. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis은 크기에 따라 핵산(DNA 또는 RNA) 조각을 분리하는 데 사용되는 전기영동 종류이다. 음전하를 띤 DNA/RNA는 전류가 가해질 때 agarose gel의 기공을 통해 gel의 양전하 말단으로 이동하고 이때 더 작은 조각이 더 빠르게 이동한다. 결과 밴드는 자외선(UV)을 사용하여 시각화할 수 있다. 2. Taq polymerase Taq polymerase는 호열성 박테리아인 Thermus aquaticus에서 추출한 열 ...2025.01.14
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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RT PCR (reverse transcription) / 100점 면역학실험 레포트 (원리, 시약, RNA 추출, cDNA 합성)2025.05.051. mRNA, transcription, translation 세포가 균의 침입을 인식하면 염증을 일으키는데, 이때 mRNA의 유무를 통해 세균 침입 여부를 알 수 있다. mRNA는 단백질 합성을 지시하는 전사체이며, 전사는 DNA를 주형으로 RNA를 합성하는 과정이고, 번역은 mRNA의 염기서열을 바탕으로 단백질을 합성하는 과정이다. 2. PCR, RT-PCR, real-time PCR PCR은 특정 DNA fragment를 증폭하는 기술이며, RT-PCR은 RNA를 DNA로 역전사하여 증폭하는 방법이다. Real-time PC...2025.05.05
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RT(역전사효소) PCR 실험 보고서2025.05.141. Reverse Transcriptase (RT) Reverse Transcription 과정을 통해 RNA 주형가닥으로부터 상보적인 DNA(cDNA)를 생성하는 효소. 1970년 RDDP의 발견 이후 눈부신 발전으로 역전사바이러스학과 암 유전학의 토대가 되어왔다. 3가지 효소활성 domain을 가지며, RNA 의존성 DNA polymerase(RDDP), C말단의 RNaseH, DNA 의존성 DNA Polymerase(DDDP)이다. 교정기능(Proofreading)이 없어 돌연변이의 누적이 쉽다. 2. One/Two step...2025.05.14
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구강상피로부터 유전자의 추출 (HKG 이용 PCR & 전기영동) 실험 보고서2025.05.141. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA를 증폭하는 기술로, 3단계(Denaturation, Annealing, Extension)로 구성되어 있다. Denaturation 단계에서는 dsDNA가 ssDNA로 분리되고, Annealing 단계에서는 Primer가 ssDNA에 결합한다. Extension 단계에서는 Taq Polymerase가 Primer를 시작점으로 DNA를 합성한다. 이 과정이 반복되면서 DNA가 지수적으로 증폭된다. 2. 전기영동 (Electrophoresis) 전기영동은 D...2025.05.14
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코로나의 영향을 분석한 진로 보고서 / 탐구주제는 코로나 진단키트, 백신, 치료제의 원리2025.01.201. 코로나 진단키트 코로나 진단키트의 이름은 RT-PCR이고, 핵심 원리는 박테리아나 바이러스처럼 눈에 보이지 않는 것을 보이게 하는 것이다. 이렇게 하기 위해서는 유전자를 증폭시켜야 한다. 이것은 기존에 있던 중합효소 연쇄반응 PCR의 원리와 거의 유사하다. 하지만 RT-PCR과 PCR의 차이점이 있다면 PCR은 검체에서 추출한 DNA를 증폭시켜 기존의 코로나바이러스와 비교하여 신종인지 아닌지 가려내기 때문에 24시간이라는 긴 시간이 소요되는 반면에 RT-PCR은 코로나19에만 존재하는 유전자를 검출해 감염 여부를 진단하는 방법...2025.01.20
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