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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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Barr body 관찰 및 PTC 미맹 테스트2025.01.041. Barr body 관찰 이번 실험에서는 구강상피세포를 채취하여 aceto-orcein 시약으로 염색한 후 광학현미경으로 관찰하여 Barr body의 구조와 특성을 확인했습니다. Barr body는 핵 내에서 핵막에 붙어 있는 응축된 X염색체로, 여성의 체세포에서 한 개의 X염색체가 불활성화되어 나타나는 현상입니다. 실험 결과 대부분의 세포에서 Barr body가 관찰되었으며, 일부 세포에서는 2개 이상의 Barr body가 관찰되기도 했습니다. 이는 세포 분열 과정에서의 이상으로 인한 것으로 추정됩니다. 2. PTC 미맹 테스...2025.01.04
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PEI 나노 복합체를 이용한 세포 내 siRNA 전달 및 RNA 간섭 평가2025.01.051. Polyethylenimine (PEI) 나노 복합체 이번 실험에서는 양이온성 branched polyethylenimine (B-PEI)를 이용해 siRNA/PEI 나노입자를 만들고, GFP-silencing siRNA를 암세포 내로 전달하여 RNA interference (RNAi) 간섭 효율을 세포 내 GFP 발현량의 감소로 확인하였다. N/P ratio에 따른 RNA 간섭 효율 변화를 살펴보았는데, N/P ratio가 높아질수록 siRNA가 더욱 응축되어 작은 나노 입자가 형성되고, 나노 입자의 표면 전하가 커져 세포막...2025.01.05
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(RNA inteference를 사용한 유전자 억제 발현 시험)2025.01.231. Transformation Transformation은 분자생물학적 현상으로 박테리아 사이에서 외래 DNA 분자를 수평으로 전달하여 세포에 도입시켜 유전자가 재조합되는 현상이다. 실험실에서는 외부 DNA segment를 세포에 삽입하여 원하는 타겟 형질을 발현시키는 방법으로 사용하며, 최근에는 비세균성 세포인 animal/plant cell에 새로운 유전자를 삽입하는 경우까지 포함한다. 형질전환은 자연 상태에서도 일어나고 실험실에서도 유도할 수 있는데, 자연계에서는 starvation이나 cell density와 같은 조건에서...2025.01.23
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겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis) 실험 리포트2025.01.141. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis은 크기에 따라 핵산(DNA 또는 RNA) 조각을 분리하는 데 사용되는 전기영동 종류이다. 음전하를 띤 DNA/RNA는 전류가 가해질 때 agarose gel의 기공을 통해 gel의 양전하 말단으로 이동하고 이때 더 작은 조각이 더 빠르게 이동한다. 결과 밴드는 자외선(UV)을 사용하여 시각화할 수 있다. 2. Taq polymerase Taq polymerase는 호열성 박테리아인 Thermus aquaticus에서 추출한 열 ...2025.01.14
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생물공정실험 예비보고서_RNA Extraction and Quantification2025.01.071. 유전자 발현과 조절 유전자 발현 경로는 전사와 번역으로 나뉘며, 전사 개시, 전사 후 가공, 번역 단계에서 조절될 수 있다. 전사 활성은 크로마틴 구조 변화, 전사인자 결합 등으로 조절되며, 전사 후에는 mRNA 가공, 번역에서는 mRNA 사용 속도 조절 등으로 이루어진다. 2. TRIzol을 이용한 RNA 추출 TRIzol 시약은 페놀-구아니딘 이소티오시아네이트로 구성되어 세포막을 파괴하고 RNase를 억제하여 RNA를 선택적으로 추출할 수 있다. 세포 용해액을 원심분리하면 RNA가 수용층에 존재하게 되며, 이후 isopro...2025.01.07
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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RNA와 식물 RNA 중합효소2025.01.141. RNA의 구조적 특징 RNA는 DNA와 구조적으로 다른 점이 있는데, 리보오스 탄소 2'에 수산화기가 존재하고 티민 대신 유라실을 이용하는 등의 차이가 있다. 또한 RNA는 단백질과 같이 접힘을 통해 3차원 구조를 형성할 수 있다. 2. RNA의 종류 RNA에는 mRNA, tRNA, rRNA 등 다양한 종류가 있다. mRNA는 DNA의 유전정보를 리보솜에 전달하여 단백질 합성을 돕고, tRNA와 rRNA는 단백질 번역에 관여한다. 또한 miRNA, lncRNA 등 유전자 발현을 조절하는 비번역 RNA도 존재한다. 3. RNA ...2025.01.14
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[예방약학실험8] Luciferase assay2025.05.101. Luciferase assay Luciferase assay는 NF-κB promoter와 luciferase reporter gene을 포함하는 plasmid를 HEK293 세포에 transfection하여 luciferase 발현을 통해 염증반응 조절에 중요한 유전자 발현을 확인하는 실험입니다. NF-κB는 염증반응 관련 유전자의 신호전달에 관여하는 전사인자로서 염증반응의 지표로 활용됩니다. 실험 결과, PMA는 염증을 유발하고 추출물 A는 항염증 효과가 있음을 확인할 수 있었습니다. GFP로 normalization을 하...2025.05.10
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