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멘델의 법칙과 진핵생물의 유전자 발현 및 조절2025.01.181. 멘델의 법칙 멘델의 법칙은 유전의 기본 원리를 설명하는 중요한 이론이다. 분리의 법칙은 개체가 두 개의 대립유전자를 가지고 있으며, 이들이 감수분열 동안 분리되어 각 배우자에게 하나씩 전달된다는 것을 의미한다. 독립의 법칙은 서로 다른 형질을 결정하는 유전자가 독립적으로 유전된다는 것을 설명한다. 멘델의 연구는 유전학의 기초를 마련하였으며, 현대 생물학과 의학 분야에서 중요한 역할을 하고 있다. 2. 진핵생물의 유전자 발현 진핵생물의 유전자 발현은 유전자가 전사와 번역을 통해 단백질로 변환되는 과정이다. 전사 단계에서는 DNA...2025.01.18
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PEI 나노 복합체를 이용한 세포 내 siRNA 전달 및 RNA 간섭 평가2025.01.051. Polyethylenimine (PEI) 나노 복합체 이번 실험에서는 양이온성 branched polyethylenimine (B-PEI)를 이용해 siRNA/PEI 나노입자를 만들고, GFP-silencing siRNA를 암세포 내로 전달하여 RNA interference (RNAi) 간섭 효율을 세포 내 GFP 발현량의 감소로 확인하였다. N/P ratio에 따른 RNA 간섭 효율 변화를 살펴보았는데, N/P ratio가 높아질수록 siRNA가 더욱 응축되어 작은 나노 입자가 형성되고, 나노 입자의 표면 전하가 커져 세포막...2025.01.05
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생물공정실험 예비보고서_RNA Extraction and Quantification2025.01.071. 유전자 발현과 조절 유전자 발현 경로는 전사와 번역으로 나뉘며, 전사 개시, 전사 후 가공, 번역 단계에서 조절될 수 있다. 전사 활성은 크로마틴 구조 변화, 전사인자 결합 등으로 조절되며, 전사 후에는 mRNA 가공, 번역에서는 mRNA 사용 속도 조절 등으로 이루어진다. 2. TRIzol을 이용한 RNA 추출 TRIzol 시약은 페놀-구아니딘 이소티오시아네이트로 구성되어 세포막을 파괴하고 RNase를 억제하여 RNA를 선택적으로 추출할 수 있다. 세포 용해액을 원심분리하면 RNA가 수용층에 존재하게 되며, 이후 isopro...2025.01.07
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[생명공학] RNA extraction, cDNA synthesis, qRT PCR2025.05.031. RNA extraction RNA를 분리하는 과정에서 가장먼저 첨가해주는 물질이 Trizol이다. Trizol은 phenol과 guanidinium thiocyanate라는 두가지 중요한 성분으로 이루어져있고 이들이 cell을 lysis하고 RNA를 안정화시키는 역할을 한다. 추가적으로 chloroform을 첨가하여 RNA와 다른 물질들을 분리한다. 2. cDNA synthesis cDNA 합성 과정에서는 reverse transcriptase 효소가 핵심적인 역할을 한다. 이 효소는 RNA를 DNA로 역전사하는 기능을 가지고...2025.05.03
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레닌저 생화학 정리노트 Ch09. DNA 기반 정보기술2025.05.101. 유전체(genome) 생물의 완전한 하나의 반수체 유전자를 의미하며, 유전체학(genomics)은 DNA에 대한 학문으로 세포와 개체 수준에서 생화학을 연구하는 학문인 system biology에 기여한다. 2. 클로닝 유전자와 그 산물에 대한 연구를 위해 동일한 복제물을 만드는 것으로, 특정 개체의 복제물(organism cloning), 특정한 유전자나 DNA 단편의 복사물(DNA cloning)을 만들 수 있다. 재조합 DNA(recombinant DNA)는 2개 이상의 소스에서 공유 결합된 조각으로 구성된 복합 DNA ...2025.05.10
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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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Barr body 관찰 및 PTC 미맹 테스트2025.01.041. Barr body 관찰 이번 실험에서는 구강상피세포를 채취하여 aceto-orcein 시약으로 염색한 후 광학현미경으로 관찰하여 Barr body의 구조와 특성을 확인했습니다. Barr body는 핵 내에서 핵막에 붙어 있는 응축된 X염색체로, 여성의 체세포에서 한 개의 X염색체가 불활성화되어 나타나는 현상입니다. 실험 결과 대부분의 세포에서 Barr body가 관찰되었으며, 일부 세포에서는 2개 이상의 Barr body가 관찰되기도 했습니다. 이는 세포 분열 과정에서의 이상으로 인한 것으로 추정됩니다. 2. PTC 미맹 테스...2025.01.04
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[예방약학실험8] Luciferase assay2025.05.101. Luciferase assay Luciferase assay는 NF-κB promoter와 luciferase reporter gene을 포함하는 plasmid를 HEK293 세포에 transfection하여 luciferase 발현을 통해 염증반응 조절에 중요한 유전자 발현을 확인하는 실험입니다. NF-κB는 염증반응 관련 유전자의 신호전달에 관여하는 전사인자로서 염증반응의 지표로 활용됩니다. 실험 결과, PMA는 염증을 유발하고 추출물 A는 항염증 효과가 있음을 확인할 수 있었습니다. GFP로 normalization을 하...2025.05.10
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재조합 플라스미드 DNA 클로닝 예비2025.05.011. 플라스미드 DNA 플라스미드는 주 염색체와 분리되어 있어 독자적으로 복제가 가능한 환형 DNA이다. 대부분은 세균에 존재하며 생존에 필수적이진 않지만 특정 상황에 유용한 유전자를 포함한다. 플라스미드는 클로닝 벡터로 많이 이용되며 재조합된 플라스미드를 세균에 유입 후 증식시켜 DNA양을 늘린다. 또는 발현벡터로 세포내의 전사,번역기구를 이용해 재조합 유전자를 발현시켜 단백질을 대량 생산시킬 때도 이용 가능하다. 2. 클로닝 생명공학에서 cloning은 세포나 DNA조각을 복제하는 과정이다. 목적DNA조각을 다량 생산하거나 DN...2025.05.01