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아주대 생물학실험1 결과보고서 [7주차 생물 정보학]2025.01.031. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 정보학의 합성어로, 생물학적 데이터의 양적 진화와 해석하는 도구의 발전을 바탕으로 발달한 학문입니다. 생물정보학의 최종적 목표는 많은 생물학적 데이터의 올바른 확립, 데이터의 올바른 분석, 그리고 의미 있는 해석과 예측입니다. 생물정보학에서는 데이터베이스 구축, 알고리즘, 소프트웨어 등 컴퓨터 기술이 활용되며, DNA 서열 분석, RNA/단백질 발현 분석, 구조생물정보학, 시스템 생물학 등 다양한 분야에 활용됩니다. 대표적인 생물정보학 기관으로는 NCBI와 EMBL-EBI가 있습니다. 2. BL...2025.01.03
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아주대 생명과학실험 생물정보학 실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 분석하고 해석하기 위한 분야로, 데이터 세트가 크고 복잡한 경우에 특히 유용하다. 이 분야는 생물학, 화학, 물리학, 컴퓨터 과학, 컴퓨터 프로그래밍, 정보 공학, 수학 및 통계를 포함한 다양한 학문을 통합하여 생물학적 데이터를 분석하고 해석한다. 생물정보학의 주요 응용 분야에는 유전체학, 단백질체학, 이미지 및 신호 처리, 텍스트 마이닝, 생물학적 및 유전자 온톨로지 개발, 유전자 및 단백질 발현 및 조절 분석 등이 포함된다. 2. BLAST BLAST(Basic Local Align...2025.01.13
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아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 수학이나 통계학을 기초로 하여 컴퓨터를 이용해 생물학을 연구하는 학문을 의미한다. BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과 같이 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘이며, BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. 다중 서열 정렬(MSA)은 3개 이상의 DNA 염기 서열 또는 아미노산 서열을 한꺼번에 묶어서 정렬하는 방법으로, 대표적인 알고리즘은 ClustalW이다. 2. BLAST BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과...2025.01.13
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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[생물학실험1] 생물정보학2025.01.191. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다. 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다. 2. NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 미국 국립생물공학정보센터로, 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터이다. 게놈 분석, 서...2025.01.19
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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PlasmidDNA Purification & Sanger Sequencing 보고서2025.01.211. Bacterial transformation 박테리아 transformation은 특정 DNA 조각을 박테리아의 유전체 내로 삽입하여 새로운 유전형질이 발현되도록 하는 방법입니다. 박테리아 plasmid는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site와 항생제 내성 유전자를 가지고 있어 외부 유전 물질을 자유롭게 삽입할 수 있습니다. 이를 통해 약 8kb의 긴 DNA 조각을 박테리아 plasmid에 삽입하여 복제할 수 있습니다. 2. Liquid LB culture 및 Colony inoculat...2025.01.21
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NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
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Analysis of PV92 Alu Insertion Frequency and Genetic Drift in Human Populations Using PCR, BLAST, and Hardy-Weinberg Equilibrium2025.01.231. PV92 Alu 삽입 PV92 Alu 삽입은 염색체 16번에 위치한 다형성 마커로, 인구 유전학 연구에 널리 사용되고 있습니다. 이 실험에서는 7명의 학생들을 대상으로 PCR, 겔 전기영동, BLAST 분석을 통해 PV92 Alu 삽입의 빈도를 조사하고, 관찰된 유전자형 빈도와 Hardy-Weinberg 평형에 따른 기대 유전자형 빈도를 비교하였습니다. 2. 유전적 부동 실험 결과와 BioServer 데이터 분석을 통해, + 대립유전자(Alu 삽입 있음)는 아시아와 남미 지역에서 더 높은 빈도를 보이고, - 대립유전자(Alu ...2025.01.23