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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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유전학2_경북대2025.05.031. DNA microarray DNA microarray는 고체 표면에 부착된 미세한 DNA 조각의 집합체입니다. DNA 칩과의 차이점은 DNA 칩은 합성된 올리고뉴클레오타이드로 배열되어 있고, DNA 마이크로어레이는 변성된 DNA가 배열되어 있습니다. DNA 마이크로어레이의 장점은 매우 희귀한 전사체도 검출할 수 있고 전사체 수준의 작은 차이도 감지할 수 있습니다. 단점은 프로브의 하이브리드화 효율이 다를 수 있고 사전 서열 지식이 필요하다는 것입니다. 2. RNA-seq RNA-seq은 각 전사체를 서열에 따라 식별할 수 있고...2025.05.03
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[생명공학] RNA extraction, cDNA synthesis, qRT PCR2025.05.031. RNA extraction RNA를 분리하는 과정에서 가장먼저 첨가해주는 물질이 Trizol이다. Trizol은 phenol과 guanidinium thiocyanate라는 두가지 중요한 성분으로 이루어져있고 이들이 cell을 lysis하고 RNA를 안정화시키는 역할을 한다. 추가적으로 chloroform을 첨가하여 RNA와 다른 물질들을 분리한다. 2. cDNA synthesis cDNA 합성 과정에서는 reverse transcriptase 효소가 핵심적인 역할을 한다. 이 효소는 RNA를 DNA로 역전사하는 기능을 가지고...2025.05.03
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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분자생물학 실험 (A+) DNA ligation and transformation 예비보고서2025.01.041. DNA ligation DNA ligation은 DNA 단편을 연결하는 과정으로, 제한효소로 절단된 DNA 단편을 연결하여 재조합 DNA를 만드는 데 사용됩니다. 이 과정에서 DNA ligase 효소가 사용되며, 이를 통해 DNA 단편의 인접한 3' 수산기와 5' 인산기 사이의 공유 결합이 형성됩니다. DNA ligation은 유전자 클로닝, 유전자 조작, 유전체 연구 등 다양한 분자생물학 실험에서 중요한 기술입니다. 2. DNA transformation DNA transformation은 외부 DNA를 세포 내로 도입하는 ...2025.01.04
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PEI 나노 복합체를 이용한 세포 내 siRNA 전달 및 RNA 간섭 평가2025.01.051. Polyethylenimine (PEI) 나노 복합체 이번 실험에서는 양이온성 branched polyethylenimine (B-PEI)를 이용해 siRNA/PEI 나노입자를 만들고, GFP-silencing siRNA를 암세포 내로 전달하여 RNA interference (RNAi) 간섭 효율을 세포 내 GFP 발현량의 감소로 확인하였다. N/P ratio에 따른 RNA 간섭 효율 변화를 살펴보았는데, N/P ratio가 높아질수록 siRNA가 더욱 응축되어 작은 나노 입자가 형성되고, 나노 입자의 표면 전하가 커져 세포막...2025.01.05
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[생화학실험] RT-PCR을 통한 간암 세포주에 대한 약물 효능 평가2025.01.291. RT-PCR RT-PCR은 역전사 반응과 PCR 반응을 이용하여 원하는 주형 mRNA의 상보적 염기쌍인 cDNA를 합성, 증폭시키는 분자생물학적 기술이다. 본 실험에서는 RT-PCR을 통해 간암 세포주 HepG2 cell에 처리한 Salsolinol이 Cyclin D1 경로에서 암세포 사멸에 유의미한 결과를 보이는지 관찰하였다. 2. Cyclin D1 Cyclin D1은 세포 주기 조절에 관여하는 단백질로, 암세포의 증식을 억제하는 역할을 한다. 본 실험에서는 Salsolinol 처리가 Cyclin D1 경로를 통해 HepG2...2025.01.29
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(RNA inteference를 사용한 유전자 억제 발현 시험)2025.01.231. Transformation Transformation은 분자생물학적 현상으로 박테리아 사이에서 외래 DNA 분자를 수평으로 전달하여 세포에 도입시켜 유전자가 재조합되는 현상이다. 실험실에서는 외부 DNA segment를 세포에 삽입하여 원하는 타겟 형질을 발현시키는 방법으로 사용하며, 최근에는 비세균성 세포인 animal/plant cell에 새로운 유전자를 삽입하는 경우까지 포함한다. 형질전환은 자연 상태에서도 일어나고 실험실에서도 유도할 수 있는데, 자연계에서는 starvation이나 cell density와 같은 조건에서...2025.01.23
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재조합 플라스미드 DNA 클로닝 예비2025.05.011. 플라스미드 DNA 플라스미드는 주 염색체와 분리되어 있어 독자적으로 복제가 가능한 환형 DNA이다. 대부분은 세균에 존재하며 생존에 필수적이진 않지만 특정 상황에 유용한 유전자를 포함한다. 플라스미드는 클로닝 벡터로 많이 이용되며 재조합된 플라스미드를 세균에 유입 후 증식시켜 DNA양을 늘린다. 또는 발현벡터로 세포내의 전사,번역기구를 이용해 재조합 유전자를 발현시켜 단백질을 대량 생산시킬 때도 이용 가능하다. 2. 클로닝 생명공학에서 cloning은 세포나 DNA조각을 복제하는 과정이다. 목적DNA조각을 다량 생산하거나 DN...2025.05.01
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